Było sobie życie - białko czy wirus?

Dotychczasowa metoda określająca powinowactwo ewolucyjne, polegająca na wielokrotnym porównaniu sekwencji, tworzyła wprawdzie drzewo ewolucyjne, ale była nieczuła na związki między odlegle powiązanymi białkami. W celu uzyskania dokładniejszych informacji o możliwym pokrewieństwie sekwencji konieczne było 'ręczne' ich wyszukiwanie przez człowieka specjalizującego się w tej dziedzinie, co wprowadzało do procedury wiele błędów. Dlatego potrzebne było stworzenie zestandaryzowanej metody do niezależnych pomiarów.

Nowa metoda opiera się na badaniu retroelementów, które składają się na około 50% ludzkiego genomu (wagowo) i są ważnym czynnikiem w wielu chorobach, m.in. AIDS. Jednocześnie z badaniami nad pochodzeniem życia i historią ewolucji zebrane zostaną dane na temat kształtu białek i ich funkcji w organizmie.

Procedura zostanie opisana w najbliższym wydaniu Proceedings of the National Academy of Sciences. Artykuł ukaże się również on-line.

Na podstawie ScienceDaily.